MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	GC	3	6	3000	3005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015579	GCT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015579	CGG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015579	GCC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015579	GCG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015579	GC	3	6	4297	4302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015579	CGC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015579	TCA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015579	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015579	GAC	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015579	GCCG	2	8	5722	5729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015579	GCG	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015579	CG	3	6	5874	5879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015579	GAT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015579	ATC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015579	AACGA	2	10	6549	6558	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015579	TCG	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015579	CGCTAA	2	12	6719	6730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015579	CGAA	2	8	6733	6740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015579	C	6	6	7745	7750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_015579	G	6	6	7780	7785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015579	TGT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015579	CGGT	2	8	7817	7824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015579	CCT	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015579	CAGG	2	8	7897	7904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015579	TCGT	2	8	7936	7943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015579	CCGGC	2	10	7952	7961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015579	TAAC	2	8	8033	8040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015579	TCA	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015579	CTG	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015579	ACTT	2	8	8753	8760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015579	GAGAC	2	10	9574	9583	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015579	GCC	2	6	9636	9641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015579	AGC	2	6	9661	9666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015579	GGC	2	6	9726	9731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015579	GC	3	6	9794	9799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015579	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015579	CGT	2	6	10103	10108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015579	TCG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015579	CG	3	6	10337	10342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015579	TCC	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015579	GCA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015579	GGT	3	9	10634	10642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015579	ATC	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015579	GTC	2	6	11183	11188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015579	GGA	2	6	11307	11312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015579	TGA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015579	TTC	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015579	GCG	2	6	11535	11540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015579	GAT	2	6	12056	12061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015579	CGGG	2	8	12063	12070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015579	AGAC	2	8	12089	12096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015579	CTC	2	6	12516	12521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015579	CGC	2	6	15020	15025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015579	G	6	6	15064	15069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015579	GC	3	6	15132	15137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015579	GCC	2	6	15202	15207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015579	CAG	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015579	GCG	2	6	15235	15240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015579	GCC	2	6	15303	15308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015579	GC	4	8	15333	15340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015579	CG	3	6	15357	15362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015579	GCA	2	6	15415	15420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015579	TCA	2	6	15429	15434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015579	CG	3	6	15500	15505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015579	CT	3	6	15510	15515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015579	CGA	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015579	CGT	2	6	15948	15953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015579	GGC	2	6	16685	16690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015579	GGCC	2	8	16769	16776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015579	TGGT	2	8	16794	16801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015579	TTG	2	6	16850	16855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015579	TGATC	2	10	22256	22265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015579	ATG	2	6	24639	24644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015579	CTC	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015579	TGT	2	6	25607	25612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015579	GC	3	6	25642	25647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015579	CAT	2	6	25691	25696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015579	GACAG	2	10	25709	25718	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015579	CGG	2	6	25757	25762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015579	CTGG	2	8	25783	25790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015579	T	6	6	27410	27415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015579	TC	3	6	27432	27437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015579	TGC	2	6	27473	27478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015579	GC	3	6	27477	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015579	ATT	2	6	32262	32267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015579	GC	4	8	34755	34762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015579	GC	4	8	34767	34774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015579	GTC	2	6	34788	34793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015579	AGC	2	6	34806	34811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015579	CTT	2	6	35170	35175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015579	GCG	2	6	39831	39836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015579	GCTT	2	8	39870	39877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015579	GATCGC	2	12	39950	39961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015579	CCA	2	6	39964	39969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015579	GAT	2	6	44804	44809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015579	CAA	2	6	44836	44841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015579	AGC	2	6	44847	44852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015579	AGG	2	6	44993	44998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015579	TCG	2	6	45007	45012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015579	GC	3	6	45047	45052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015579	GCG	2	6	45107	45112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015579	CGG	2	6	45143	45148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015579	GC	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015579	CGG	2	6	45317	45322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015579	AGA	2	6	45362	45367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015579	ACTG	2	8	45376	45383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015579	AGCTG	2	10	45411	45420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015579	TCC	2	6	45423	45428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015579	TCG	2	6	45487	45492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015579	GGGC	2	8	45496	45503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015579	CGG	2	6	45539	45544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015579	GCG	2	6	45577	45582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015579	GCTT	2	8	45618	45625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015579	CTTGTG	2	12	45628	45639	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015579	CCGT	2	8	45721	45728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015579	GAC	2	6	46406	46411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015579	TGC	2	6	46450	46455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015579	GCA	2	6	46459	46464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015579	A	7	7	46489	46495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015579	GGC	3	9	47305	47313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015579	TGC	2	6	50365	50370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015579	CAA	2	6	50410	50415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015579	ATCG	2	8	50428	50435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015579	AGCC	2	8	50468	50475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015579	CCG	2	6	50559	50564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015579	TTC	2	6	50570	50575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015579	GCTCAC	2	12	50634	50645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015579	GTC	2	6	50664	50669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015579	CGA	2	6	50946	50951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015579	GTCG	2	8	52064	52071	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015579	CGG	2	6	52092	52097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015579	TGCC	2	8	52098	52105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015579	GCC	3	9	52103	52111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015579	TG	3	6	53045	53050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015579	TAA	2	6	53055	53060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015579	GAA	2	6	53103	53108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015579	GA	3	6	53137	53142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015579	CAGG	2	8	53451	53458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015579	ATG	2	6	53638	53643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015579	CGGCG	2	10	53700	53709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015579	GGC	2	6	53710	53715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015579	GC	3	6	53714	53719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015579	GC	3	6	53793	53798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015579	CGG	2	6	53844	53849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015579	TCG	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_015579	GGC	2	6	105038	105043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_015579	GCCC	2	8	105248	105255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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420	NC_015579	AT	3	6	128671	128676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015579	CTGCA	2	10	128686	128695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_015579	CAA	2	6	128696	128701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_015579	TGCAG	2	10	128707	128716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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426	NC_015579	CTT	2	6	128918	128923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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448	NC_015579	CGG	2	6	136411	136416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_015579	TCA	2	6	136435	136440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_015579	CGG	2	6	136478	136483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_015579	CTC	2	6	137741	137746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
462	NC_015579	GC	3	6	137755	137760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_015579	CGC	2	6	137768	137773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_015579	GGC	2	6	137779	137784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_015579	TCCT	2	8	139263	139270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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488	NC_015579	GCG	2	6	143795	143800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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